Vài tháng sau trận chiến với Makima, thế giới dường như đã phần nào bình yên... nhưng với những hybrid được giải phóng khỏi Makima giờ đây cũng chẳng hề tự do hoàn toàn. Họ bị Cục giam giữ hoặc giám sát chặt chẽ, 

Tình hình càng trở nên tồi tệ khi đội ngũ nhân lực thiếu hụt trầm trọng. Các nhiệm vụ nguy hiểm chồng chất, và dường như không còn ai đủ sức gánh vác.

Trong lúc bế tắc đó, Kishibe xuất hiện với một đề xuất vừa mạo hiểm vừa đầy tiềm năng. Đôi mắt ông lóe lên sự tự tin, như muốn nói rằng: "Nếu làm được, chúng ta sẽ xoay chuyển cả tình hình này."